价格便宜，操作简单，但由于可见光波长的限制，其放大倍数只能达到1000倍左右；传统大型扫描电子显微镜有效放大倍数可以达到数万倍，具有大景深，是当前材料科学、生物科学领域zui常用的表征手段之一，但其投资巨大，而且需要经过严格培训的操作人员，使用不便。
台式扫描电子显微镜价格相比其他的略微不一样。是飞纳电镜系列中先进的产品，第四代 Phenom Pro 放大倍数提升为 130,000 倍，分辨率优于 14 nm，30 秒快速得到表面细节丰富的高质量图像，是目前世界上分辨率zui高的台式扫描电镜。
台式扫描电子显微镜的分辨率主要决定于样品表面上电子束的直径。放大倍数是显像管上扫描幅度与样品上扫描幅度之比，可从几十倍连续地变化到几十万倍。扫描式电子显微镜不需要很薄的样品；图像有很强的立体感；能利用电子束与物质相互作用而产生的次级电子、吸收电子和X射线等信息分析物质成分。
