飞纳桌面扫描电镜分为镜体和电源电路系统两部分。镜体部分由电子光学系统、信号收集和显示系统以及真空抽气系统组成。扫描电镜由电子枪发射出来的电子束，在加速电压的作用下，经过磁透镜系统汇聚，形成直径为5nm，经过二至三个电磁透镜所组成的电子光学系统，电子束会聚成一个细的电子束聚焦在样品表面。在末级透镜上边装有扫描线圈，在它的作用下使电子束在样品表面扫描。
电子光学系统由电子枪，电磁透镜，扫描线圈和样品室等部件组成。其作用是用来获得扫描电子束，作为信号的激发源。为了获得较高的信号强度和图像分辨率，扫描电子束应具有较高的亮度和尽可能小的束斑直径。
检测样品在入射电子作用下产生的物理信号，然后经视频放大作为显像系统的调制信号。现在普遍使用的是电子检测器，它由闪烁体，光导管和光电倍增器所组成。
飞纳桌面扫描电镜用于造纸业的时候，要想观察到纸张或浆张内纤维的微细结构，只需将风干试样固定在样品台上，利用真空镀膜法在要观察的样品表面覆盖一层金属（通常采用镀金，主要为了导走入射电子束流，避免样品表面荷电）后，即可在扫描电镜中观察和拍照。
对制浆进行分析：
1、可以对两种浆进行对比分析，并结合成浆物理指标做出解释
2、细胞壁形态变化
3、带状纤维数量
4、纤维弯曲、扭转状态
5、纤维分离程度
对纸张进行分析：
1、加入添加剂前后纤维的变化等信息
2、原浆纤维以及处理后纤维的光滑程度
