全自动扫描电子显微镜符合人体工学的设计
的制备腔室直接安装于电镜镜筒，而制备腔室的先进的制冷系统和涡轮分子泵的安装远离SEM，这样可以保证极少的物质直接进入SEM。
全自动扫描电子显微镜样本转移直接从高真空到另一个高真空，极大的降低了样本结霜污染的风险，同时系统使用起来更流畅，操作者无论移动样本从制备腔室到SEM冷冻台或反之都很方便。全自动扫描电子显微镜是控制平台，人体工程学的操作平台，友好直观的彩色触摸屏，可弯曲的LED灯，这些均可以帮助使用者更好的进行各项工作。
全自动扫描电子显微镜面上有一个抽气管内嵌其中，用来存放样品传输装置，当样品传输装置不用时，可以保存洁净、干燥真空状态，不断变换位置的样品安装杆提供一个坚固的样品装载基座，杆上有一个样品高度计量来确保装载的样品在一个可以被仪器接受的范围内。全自动扫描电子显微镜操作触屏安装在可弯曲基座上，通过基座可以调整触屏的角度来满足操作仪器的人一目了然仪器的基本参数。
全自动扫描电子显微镜友好直观的彩色触摸屏，允许用户自定义方案，它可快速输入和储存以便随时访问调用。屏幕可设置成适合不同操作者及其喜好的模式（例如：模拟式或数字式真空测量显示）。虽然样品制备过程中许多关键步骤是自动完成的（气锁抽真空，升华刻蚀，溅射镀膜等）但通过用户友好的视频可立刻给出进一步的帮助。
